根据工作内容，中心设数据技术应用服务部和综合应用开发用户服务部两个部门，其工作职责如下：

数据处理技术应用服务部：负责GPS数据处理技术的应用，GPS数据服务的提供，通讯模块和移动GPRS卡管理维护，为网络RTK用户提供服务；网络及数据安全管理，网络日常维护和不断优化；新技术的开发应用；负责TOPNET软件的维护；负责数据整理（备份、归档）和信息得管理等方面的工作。

综合应用开发用户服务部：负责SDCORS各站点和中心设备运营管理和日常维护，系统站点调整协调和组织实施，市场开发与推广，各类用户的发展及服务，SDCORS网站的日常维护和网络服务的日常管理，中心的日常办公管理及督办领导交办的各类工作。